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Medición de similitud semántica para ontologías de líneas celulares

Medición de similitud semántica para ontologías de líneas celulares


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Tengo un conjunto de pares de líneas celulares y quiero saber en qué medida los pares son similares en función de sus ontologías. El problema que tengo es que encontré una biblioteca de Python llamada Fastsemsim, pero tiene muchas medidas de similitud. O para ser exactos, en realidad hay muchas medidas de similitud de ontologías. Y quiero saber qué medida de similitud es la más adecuada para mi caso (similitudes de ontologías de líneas celulares). Puede haber un par de buenos que sean buenos para las ontologías celulares. Se trata de un conjunto de medidas de similitud que están disponibles en Fastsemsim.

Similitud semántica

  • SemSim.TermSemSim
  • SemSim.ObjSemSim
  • SemSim.ObjSetSemSim
  • SemSim.SetSemSim
  • Medidas específicas de similitud semántica
  • SemSim.MixSemSim
  • SemSim.avgSemSim
  • SemSim.maxSemSim
  • SemSim.BMASemSim
  • SemSim.SemSimUtils

Fuente: https://fastsemsim.readthedocs.io/en/latest/library.html


Ver el vídeo: Past Similitud y dendrogramas (Mayo 2022).